pcr檢測-英瀚斯(在線咨詢)-pcr
外顯子測序
外顯子組測序(exome-seq)是對定向富集的*組dna進行高通量測序,它能夠以相對低的費用對人類外顯子組進行拷問。2009年,外顯子組捕獲工具的出現,讓外顯子組測序這種技術迅速紅起來。到目前為止,已有超過1萬個外顯子組被測序。
如今有多家公司推出了外顯子組捕獲*,包括羅氏nimblegen、安捷倫、illumina,還有現在的華大*。這些方法究竟孰優孰劣,斯坦福大學醫學院遺傳學系的研究人員對市場上三個主流的外顯子組測序平臺進行了比較。該研究結果發表在《nature biotechnology》上。研究人員利用安捷倫、illumina和nimblegen的外顯子組測序平臺對同一個人類血液樣品進行分析。他們的結 果表明,nimblegen平臺作為一個使用高密度重疊探針的平臺,盡管覆蓋了較少的*組區域,但在靈敏檢測小的變異時所需的測序量也少。在同樣獲得80m測序數據的情況下,nimblegen有97%的目標序列達到10x以上的測序深度,而其他產品只有90%。而安捷倫和illumina的探針能夠在低密度下捕獲更多數量的變異。此外,illumina還捕獲了未翻譯的區域,這是nimblegen和安捷倫平臺無法靶定的。研究人員還比較了同一樣品的外顯子組測序和全*組測序(wgs),顯示外顯子組測序能夠檢測到wgs錯過的小變異。
除了文中提到了三個主流平臺,外顯子組捕獲方面的新產品也在不斷推出,熒光定量pcr,研究人員的選擇也將更廣泛。羅氏nimblegen即將推出新一代的外顯子液相捕獲產品。這一新產品將可捕獲64m的*組序列,包括外顯子以及mirna,它含與其他nimblegen液相捕獲產品相同的2.1m高密度探針,以高xiao、均一、特異、的定向捕獲。
染色質免l疫共沉淀技術(chip)
基于體內分析而發展的染色質免l疫沉淀分析chr omat in immunoprecipitat ionassay kit, chip)技術可以真實、完整地反映結合在dna序列上的調控蛋白。由于chip采用甲醛固定活l細胞或者組織的方法,因此能比較真實的反映細胞內tf與promoter的結合情況,還可以用來研究組蛋白的各種共價修飾與*表達的關系。近年來,這種技術得到不斷的發展和完善。采用結合微陣列技術在染色體*表達調控區域檢查染色體活性,是深入分析*l癥、心血l管病以及**系統紊亂等疾病主要通路的一-種非常有效的工具。
染色質免l疫沉淀分析(chip) 的基本原理是在活l細胞狀態下,當用甲醛處理時,相互靠近的蛋白與蛋白、蛋白與核酸(dna或rna)之間會產生共價鍵。細胞內,當f與promoter相互結合時,pcr檢測,它們必然靠的比較近或者契合在一起,這個時候用甲醛處理,能使它們之間產生共價鍵。固定的蛋白質dna復合物通過超聲或酶處理將其隨機切斷為-定長度范圍內的染色質小片段然后通過*原*l體的特異性識別反應沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結合的dnal片段,實時熒光定量pcr,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質與dna相互作用的信息。通過qpcr或二代測序,篩選與目的蛋白互作的未知dna信息。
分子生物學檢測
分子生物學作為現代生物技術中*為*的實驗手段之一,pcr,已經廣泛滲透到生命科學的各個領域,在基礎研究、醫l療診斷等領域均起到了非常重要的作用。
借助*的技術優勢,英瀚斯生物特配備了高l效的儀器設備,如slan 48p 熒光定量pcr檢測系統、pcr儀、電泳儀、冷凍離心機、高速離心機等。目前公司可為您提供反轉錄pcr、熒光定量pcr、凝膠電泳遷移率等檢測服務,大大縮短您的實驗周期、降低您的實驗成本。
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